2013年由福建省科技厅批复建设。实验室围绕福建及南方山地农业开发与区域资源利用的特点，深入探讨山地现代生态农业发展过程中物质循环、能量流动、水分迁移、熵情变化、资源利用、匹配规律、运行模式等一系列科学问题与配套技术，构建与实践红壤山地高效优质生态农业技术模式，为红壤区现代生态农业发展提供理论依据与技术支撑。自实验室建立以来，先后获得省部级科技进步一等奖2项，二等奖5项，省自然科学三等奖1项。实验室也是先后在福州、建阳、安溪、尤溪、福安等地建立水土保持、土壤质量观测的长期定位站点8个，其中1个站点入选福建省首个国家农业科学观测实验站。