酒类酿造菌种工程化实验室于2016年由福建省农业科学院批准设立,依托于福建省农业科学院农业工程技术研究所,占地逾3000㎡,总建筑面积1267㎡,于2017年完成建设并投入使用。建有库存量达万株的食品微生物资源库1个、食品发酵菌剂小型生产线1条、酒类产品鉴品室及质量分析室。
该实验室主要承担食品发酵微生物资源挖掘为主的科学研究、中间试验、转化示范、人才培养等任务,近年来选育优良发酵菌株十余株、保藏菌种2080株,创制了适用于果酒、果醋及乳酸发酵饮料等的发酵菌剂5种,为技术成果中试生产、新产品创制提供了小型中试设备及场所,为行业发展提供技术信息咨询、科技交流等服务。