十八大以来，共新建省部级以上科技创新平台28个，新增创新平台建设资金1.12亿元，全院省部级以上平台达120个，其中国家工程实验室、国家地方联合工程研究中心、国家种质资源圃、国家观测试验站等国家级、部级平台55个；福建省重点实验室、福建省工程技术研究中心、福建省野外观测研究站等省级平台65个，涵盖了水稻、果树、畜牧兽医、植物保护、土壤肥料、茶叶、作物、食品科学与农业工程、亚热带农业、农业经济与科技信息、农业生态、生物技术、农业生物资源、食用菌等研究领域。同时我院还承担了国家现代农业产业技术体系（8个岗位科学家、9个综合试验站站长）和福建省现代农业产业技术体系（3个首席专家、9个岗位专家）的建设工作。