农业农村部东南区域微生物资源利用科学实验观察站于2011年国家农业农村部批准设立，依托福建省农业科学院，以海峡西岸（福建省和周边）为重点，兼顾全国特色生态区，收集、研究、利用芽胞杆菌等微生物资源。对于开展农业微生物资源收集、分离、保存、鉴定、评价、利用具有重要意义。本学科群以农业微生物资源利用综合性重点实验室为龙头，以6个专业性重点实验室为骨干、以5个科学观测实验站为延伸的重点实验室体系。

“实验站”工作目标：（1）系统开展农业微生物资源收集与保藏长期性科研工作，提升我国微生物资源研究水平;（2）开展高效优异功能菌株筛选与评价，提高农业微生物种质效能;（3）构建智能化的农业微生物资源公共平台，对外实现科技数据共享;（4）研究个性化的微生物发酵生产工艺技术，研发原创性知识产权的农业微生物生防制剂。

建设六个科研平台：（1）农业微生物资源筛选平台；（2）农业微生物生物技术平台；（3）农业微生物发酵技术平台、（4）农业微生物菌剂工艺平台；（5）微生物益生菌产品加工平台；（6）微生物有效成分提取平台；用3-5年时间，通过拓宽研究与开发领域，强化技术创新与转化功能，使“实验站”成为农业微生物资源收集与鉴定评价的研发实体；通过工程化研究，把研究成果转化为高新技术产品，为规模产业化提供必要的技术数据；成为面向两岸及全国开放的农业微生物技术研究开发中心和技术领域高级人才培养基地。

研究方向：作物土传病害微生物杀菌剂的研究与利用，环境微生物与资源高效利用。其任务分工为：开展具有闽台特色的微生物资源科学观测与研究，收集整理热带农业微生物科学相关原始资料和科研基础数据并予以信息化；开展东南区农业微生物资源收集、保存和农业生物药物新品种的研发与示范。

　　芽胞杆菌资源采集-祁连山芽胞杆菌杆菌资源采集

　　首席专家刘波博士进行青海芽胞杆菌资源调查

　　朱育菁进行菊花病害防控研究

　　研究人员田地间交流

　　温室大棚