檀俊秩同志爱岗敬业，长期坚守在畜禽遗传育种研究工作第一线。开拓进取，求实创新，刻苦钻研，以身作则，团结协作，科研密切联系生产，精益求精，为我国高产蛋鸭、白羽半番鸭等选育做出了突出贡献，先后获省部级以上科技奖5项，其中排名第一的获奖成果有4项：国家三等奖1项，省二等奖1项，省三等奖2项；以主要完成人参加的1项：省二等奖1项。在全国水禽育种理论和实践特别是数量遗传学和生理生化等方面研究应用享有较高的知名度。

潜心育种，高产蛋鸭配套系选育研究工作走在全国前列。

莆田黑鸭原产于福建省沿海各县，以莆田县的黄石、笏石、灵川等乡为中心产区，属于中国麻鸭黑色变种，列为中国家禽品种志的蛋鸭品种，但产蛋量偏低，制约了其生产的发展。为充分挖掘莆田黑鸭种质特性，提高莆田黑鸭产蛋性能，在陈晖研究员等前期研究基础上，1983年在院重点课题《莆田黑鸭高产系选育》资金资助下，檀俊秩研究员带领团队潜心钻研，采用以父系为主的家系选择结合家系内个体选择法，估测莆田黑鸦核心群中主要经济性状遗传参数指导选育实践。同时对蛋鸭饲料中能量、蛋白质和蛋氨酸对蛋鸭产蛋性能的影响研究，提出了蛋鸭在圈养营养需要量；开展蛋鸭早期选种研究，应用鸭胚组培液活性与生产性能的相关，早期评定种用价值，可以缩短了育种世代间隔，提高了育种效率。核心群经过六个世代的选择育成了莆田黑鸭蛋多和蛋重两个品系。500日龄平均产蛋数：蛋多系296个，蛋重67.05克；蛋重系285个，蛋重68.94克。比第一世代243.23个，分别增加53和42个，提高21.8%和17.3%。莆田黑鸭高产系的选育成功不仅大大提高莆田黑鸭产蛋性能，产生显著的社会经济效益，而且为我国蛋鸭配套系选育提供了重要素材。该研究论文在1988年国际水禽生产学术讨论会上发言。该研究成果1989年获得福建省科技进步二等奖；经过2年的熟化和加大推广应用，1991获得国家科技进步三等奖。　　

1987年在省科委项目《蛋鸭配套品系选育》的支撑下，以莆田黑鸭高产系为素材，通过对鸭青壳性状遗传规律研究，用隐性测交方法，揭示鸭蛋壳性状是由一对等位基因显性青壳基因和隐性白壳基因控制，青壳对白色为显性，选育出莆田黑鸭青壳蛋新品系。利用该青壳系与已选育的高产系，应用不完全双列杂交法进行系间配合力测定，筛选出最佳配套组合。配套系产蛋量高达344个，中试达305-310个。1991年该配套系通过同行专家鉴定，为国内先进水平。1988-1991年该配套系在生产上得到广泛应用，推广面达87万只，产生了显著的经济社会效益。

攻克难关，成功选育出中型白羽半番鸭母本并大规模推广应用。

羽色是半番鸭一个重要的经济性状。传统的半番鸭羽色几乎是黑褐色，屠宰后胴体留有黑色针羽，严重影响胴体外观和销路，不适应集约化生产加工。改良半番鸭羽色正是生产的迫切需求。为探明半番鸭羽色性状的遗传机制，从上世纪90年代初檀俊秩及其团队就开始致力于半番鸭羽色遗传机制的研究，揭示了半番鸭羽色遗传机制，建立白羽半番鸭选育路线，应用于优质白羽母本选育实践，选育出中型白羽半番鸭母本，填补了国内空白，为国内各地区开展半番鸭选育研究提供良好借鉴。经过10年的精心选择，选育出后代半番鸭白羽率高达95%且产蛋性能高的中型白羽半番鸭母本，建立白羽半番鸭良种繁育体系，改写了长期以来生产黑褐色羽半番鸭的历史，使半番鸭从传统的低水平生产向高层次集约化生产转变。“半番鸭白色羽毛遗传及其应用研究”获2001年度福建省科技进步三等奖。2001年与福建省农业厅、龙岩市山麻鸭原种场实施省计委“优质白羽半番鸭及示范推广”项目，继续对中型白羽半番鸭母本产蛋量、后代半番鸭羽色和生长速度等性状进行选育提高，经过2年的熟化，母本500日龄产蛋量达253个，后代半番鸭白羽高达99%。至此我省半番鸭4000多万只已基本被白羽半番鸭替代，另外，每年还大量的向广东、江西、浙江、江苏、湖南、湖北等省份提供白羽半番鸭，产生了巨大的经济效益。

山麻鸭高产系选育：1992年起檀俊秩研究员，应邀帮助指导龙岩市山麻鸭原种场开展山麻鸭高产系选育工作，提出山麻鸭高产系选育的技术路线，应采用“家系选育结合家系内个体选育”的方法进行。因为家系选育能够比较全面客观地反应家系群体的生产水平，但选育的进展比较慢，选育所需的时间较长。而个体选育能够直观地反应某一个体的生产性能的高低，选育的进展较快，但容易受到饲料、环境条件的影响，进展不稳定，因此建议采用“家系选育结合家系内个体选育”的方法进行选育。在檀俊秩研究员的指导帮助下，项目经过8年6个世代的努力，于1999年成功培育出山麻鸭高产系。该高产系500日龄产蛋299.2枚、产蛋重19.2千克，饲料转化率3.05:1，比选育前的500日龄产蛋259枚、产蛋重15.7千克，饲料转化率3.36:1，分别提高15.5%、22.3%和10.2%。经广泛推广后，各地山麻鸭的产蛋量普遍从年产250枚提高到年产280—290枚，山麻鸭高产系的选育，为山麻鸭生产的发展做出了积极贡献，为此山麻鸭高产系选育于2001年分别获龙岩市科技进步二等奖，获福建省科技进步三等奖。

山麻鸭配套系选育：为充分挖掘利用山麻鸭遗传资源优势，进一步提高其产蛋性能，2002年在省科技厅的支持下，原种场场又承担了省科技重大专项“山麻鸭配套系选育”项目，对于该项目檀俊秩研究员就提出“山麻鸭配套系选育”的鸭种应以我省的蛋用鸭种为素材的技术思路。福建是水禽大省，省内有多个蛋鸭品种，且生产性能高，适应性强，且各鸭种具有各自的特点，如果在省内的蛋用鸭种寻找几个鸭种进行杂交配套，可充分吸收其优特点，达到预期的目的。根据檀俊秩研究员的观点，研究采用以山麻鸭高产系为主，引入莆田黑鸭、闽农白羽蛋鸭、金定鸭、卡几康贝尔鸭等高产蛋鸭的血缘，通过配套杂交的方法提高产蛋水平。到2008年，经过6年的选育，在16个杂交组合中，筛选出产蛋量最高的配套组合，其500日龄产蛋达到345.4枚、产蛋重25.12千克，饲料转化率2.65:1，比山麻鸭高产系的性能分别提高15%、30.8%和13.1%。产蛋量、饲料转化率等主要生产指标都达到国内领先水平，在国际上也处于领先地位。山麻鸭配套系项目，2008年获龙岩市科技进步一等奖，2009年获得福建省科技进步三等奖。