福建省农业科学院漳州分院成立于2020年12月，由福建省农业科学院与漳州市人民政府联合共建。漳州分院以漳州市农科所、福建省农业科学院亚热所为依托，集聚省农科院多个专业研究所和漳州市农业农村局等单位的科技、人才资源，合作建立食用菌研究中心、水稻研究中心、园艺作物研究中心、农产品精深加工研究中心、生态农业研究中心等5个研究中心。

漳州分院主要围绕漳州区域优势的水果、食用菌、茶叶、设施蔬菜、中药材等当地特色产业，开展农作物新品种选育与引进、现代农业关键技术集成、畜禽废弃物循环利用、农产品精深加工等领域合作研究与成果转化，着力提升漳州市农业科研创新综合实力。