“农业农村部亚热带特色果蔬菌加工重点实验室”是由福建省农业科学院（牵头）与福建农林大学为依托单位，建立的部省共建重点实验室。2022年9月由农业部批准建设。实验室针对我国大宗亚热带特色水果蔬菜和食用菌等加工过程中存在的重大关键性技术问题，突破一批产业关键技术，解决亚热带果蔬菌加工与质量控制行业共性问题；通过实验室的运行，使亚热带特色果蔬菌精深加工技术进一步提升，促进整个亚热带果蔬菌产业的快速发展，推动乡村振兴，推进农业农村现代化的进程。

实验室在集中最优势人才资源的基础上，进一步向海内外招聘优秀人才，目前形成以国家特支计划人选、国家“万人计划”科技创新领军人才、科技部中青年科技创新领军人才、国务院特殊津贴专家为学术方向带头人、一批年富力强的中青年学术骨干、年青的海外留学归国博士为中坚力量的研究队伍。

实验室实行主任负责制，设置主任、副主任、行政秘书和课题负责人等岗位。实验室将本着“协同创新、开放共享”的原则，利用现有科研设施和学术环境，面向国内外开放，增加请进、派出和互访活动，发展和扩大与国内外高校、科研机构、企业的学术交流和合作。通过几年努力，最终将实验室建设成为我国亚热带特色果蔬菌加工应用基础、技术研究和示范为主的专业性科研创新基地和学术交流重要平台。