农业微生物研究中心现有固定工作人员23人，其中国家百千万人才1人、国务院特殊津贴专家1人，研究员4人、副研究员9人，博士12名、硕士8名，另有客座研究人员6人，常年与厦门大学、福建农林大学等高校联合培养博士、硕士约5人/年。主要从事以芽胞杆菌为主的农业微生物资源的研究与应用，已建成了我国规模最大的芽胞杆菌资源库，在芽胞杆菌的系统分类学、基因组学、代谢物质组学分析及功能菌株挖掘、菌剂创制与应用等方面达到国际先进水平。

二、主要研究方向

主持国家重大科技专项、国家863、948项目、国家自然科学基金、农业部公益性行业专项等上百个国家和省级项目的研究工作，承担13个国家、省部级科研平台的建设任务，主要开展以下四个方向的研究工作。

（一）芽胞杆菌资源收集与基础研究：采集了全国各地土壤样品1.6万多份，保存菌株3.8万株，引进模式菌株260余种，发表芽胞杆菌新种13种；完成85种芽胞杆菌全基因组首次测序，对98个种300多菌株进行物质组学分析，首次发现羟苯乙酯等6个具有免疫抗病活性物质。

（二）芽胞杆菌功能菌株的挖掘：开展具有杀虫、抗病、保鲜、固氮、解磷、解钾、降污等功能菌株筛选，挖掘新型杀虫、抗病等功能基因，并利用生物藕合技术研制新型藕合型生物农药，制备多功能微生物肥料（药）、保鲜产品。

（三）微生物发酵床研究与应用：创建原位、异位、低位、饲料发酵床微生物治理技术体系，创新了发酵床垫料资源化利用技术与装备，实现养殖副产物的资源化利用。

（四）芽胞杆菌菌剂产品研发与应用：创制出芽胞杆菌微生物菌剂（肥料）产品15个与功能性生物基质产品4大类17个；研制出机器人堆垛自发热隧道式固体发酵微生物菌剂（生物基质）自动化生产线，实现产业化生产和大面积应用。

三、主要工作成效

截至2018年9月，共发表研究论文600多篇、其中英文论文85篇，出版著作19本；获得国家科技二等奖1项（参加），省部级一等奖3个、二等奖5个、三等奖2项；获得专利授权35项，制定福建省地方标准1项。

四、服务三农和企业

微生物研究中心的科研人员经常深入田间地头，示范推广生物农药的使用，指导农户防治青枯病、枯萎病等作物病害；积极推动发酵床养猪技术的推广应用，促进健康和谐养殖环境的构建和养殖产业的可持续发展；研制出的微生物菌剂产品和生物基质产品获得了广泛的推广应用，给企业、农户带来的效益达30亿元以上，取得了良好的经济、生态和社会效益。