您当前的位置:福建省农业科学院亚热带农业研究所 > 最新动态
亚热所揭示青枣转录因子超家族进化机制并基于机器学习筛选候选基因
发布时间:2026-06-28  点击量:  来源:亚热所  
  近日,福建省农业科学院亚热带农业研究所姜帆副研究员团队在中科院二区期刊《The Plant Genome》上发表了题为“Haplotype-resolved comparison of transcription factor superfamilies between wild and cultivated autotetraploid green jujube and prioritization of candidate transcription factors via machine learning”的研究论文。该研究首次整合单倍型解析基因组、单倍型解析转录组图谱与机器学习技术,对同源四倍体青枣(Ziziphus mauritiana)的42个转录因子超家族进行了系统鉴定与比较,揭示了野生与栽培青枣之间转录因子基因的演化保守性,并利用机器学习模型筛选出一个与果实代谢差异密切相关的候选转录因子基因家族。
  本研究系统描绘了青枣转录因子超家族的完整图谱,揭示了多倍化和驯化过程对转录因子基因家族的演化影响。更重要的是,该研究展示了“单倍型解析基因组—单倍型解析转录组—机器学习”整合分析框架在复杂性状基因发掘中的强大能力。研究筛选出的候选基因为未来通过分子育种手段改良青枣果实品质提供了宝贵的基因资源和理论依据。
  该研究得到了福建省公益类科研院所基本科研专项、漳州市自然科学基金、国家热带植物种质资源库闽台特色作物种质资源分库以及国家闽台特色作物种质资源圃(漳州)等项目的资助。朱旭东博士为论文第一作者,常鹏艳为共同第一作者,姜帆副研究员为通讯作者。(文/图:亚热所 朱旭东)