福建省作物分子育种工程实验室是在福州国家水稻改良分中心一期、二期建设的基础上,2008年经福建省发展和改革委员会立项,批准建设(闽发改高技【2008】654号文),项目建设依托福建省农业科学院水稻研究所和作物研究所。实验室总面积近3000m2,仪器设备价值1500多万元。主要开展农作物种质资源的评价与创新、功能基因组学与分子育种、农作物新品种培育等研究。实验室的建成为海峡西岸农作物遗传改良和育种研究提供了良好的科研平台。
实验室现有研究人员71人,其中专职科研人员65人,后勤管理人员6人;中国科学院院士1人,国家级专家3人,具有高级技术专业职称32人,具有博士学位15人,硕士学位39人。实验室每年与福建农林大学、福州大学和福建师范大学共同招收、培养硕士研究生15人,博士研究生5人。
实验室和国内外的科研单位、高校建立了广泛的联系,如中国科学院遗传和发育生物学研究所、中国科学院植物研究所、中国水稻研究所、中国农业科学院作物科学研究所、北京大学、中国农业大学、福建农林大学、国际水稻研究所、美国加洲大学河滨分校等;积极参与国内外各种学术交流,热情邀请国内外的同行专家来实验室进行合作、交流和指导。