2000年12月19日，经国家农业部批准（农计函【2000】213号），同意在福建省农业科学院稻麦研究所建立福州国家水稻改良分中心，一期建设于2005年9月底顺利竣工，2005年11月16日通过验收。“国家水稻改良中心福州分中心二期建设项目”系中华人民共和国农业部于2006年7月28日以（农计函【2006】171号）文件下达《关于青海省国家种质资源长期复份库改扩建和16个农作物改良中心（分中心）建设项目可行性研究报告的批复》，2007年6月11日福建省农业厅以（闽农计[2007]123号）文件下达《关于国家水稻改良中心二期建设项目初步设计的批复》的建设方案，同意福建省农业科学院在福州市南郊仓山区城门镇连坂村农科院水稻所建设国家水稻改良中心福州分中心二期项目，经过2年多的紧张有序的施工，于2009年4月竣工，2009年6月30日通过验收。

该中心建成后主要以杂交水稻种质创新和新品种选育为研究方向，实现水稻生产的“高产、优质、高效、生态、安全”的目标，建立水稻重要种质性状与基因鉴定平台，开发重要性状基因的功能性和实用性分子标记，改良分子标记检测技术，提高规模化应用水平；构建高效的分子育种技术体系，提高育种效率；突破规模化发掘种质资源中优异基因的技术瓶颈，实现多目标重要性状的定向改良，提高水稻育种效率。将常规方法与分子育种技术相结合，着重于优异种质的发掘、利用与育种材料创新；从群体水平、个体水平和分子水平等不同层次对水稻遗传行为和品种改良开展系统而深入的研究，为水稻的遗传改良提供新理论、新技术、新方法、新材料和新品种；构筑学术交流桥梁，成为我国南方稻区乃至海峡两岸水稻科学研究和学术交流中心；成就一支梯队结构合理，具有创新、协作、精诚团结的科研队伍。

通过几年的运行，取得了较好的经济效益和社会成果，培养了一批人才，育成了一大批超级杂交稻和研发多项栽培新技术等成果在生产上应用，取得了显著的成绩。

国家水稻改良中心福州分中心牌匾　　

国家水稻改良中心福州分中心种质创新与分子育种实验室牌匾　　　

揭牌　　

2009年9月10科技部党组成员、纪检组长郭向远一行考察实验室　　

2009.10.8农业部闽台农作物种质资源利用重点开放实验室第一届学术委员会第2次（2008-2009）学术年会学术委员会成员